Las palabras Homófonas, por Alan.

En español no todas las palabras homófonas son homógrafas, debido a que no existe una relación uno a uno entre el conjunto de letras y el de fonemas, estos son algunos ejemplos:
En cuanto a palabras con y sin h destacan:
Deshecho (del verbo deshacer) frente a desecho 'desperdicio'
Honda 'profunda' con onda 'ondulación'
Hay (del verbo haber) con Ay (exclamación)
Aré (del verbo arar) con haré (del verbo hacer)
Arte (virtud y habilidad para hacer algo), harte (del verbo hartar)
As (campeón), has (del verbo hacer).
Con las palabras con G y J destacan:
agito (del verbo agitar), y ajito' 'ajo pequeño'.
Con las letras B y V destacan:
Baso (verbo basar), Vaso (recipiente para depositar líquido)
Barón (título nobiliario), Varón (hombre)
Barita (óxido de bario), varita (vara pequeña)
Bate (palo usado para golpear la pelota), vate (poeta)
ballenato (cría de la ballena), vallenato (género musical colombiano).
Baya (fruto carnoso), valla (cerco, barrera)
Con Y o LL destacan en los dialectos yeístas:
Rallar (desmenuzar) con Rayar (hacer rayas)
Arrollo (verbo de arrollar); Arroyo (río pequeño)
Aya (mujer que cría niños), haya (árbol; forma del verbo haber)
Valla (cerca) con Vaya (del verbo ir)
La halla (la encuentra) frente a La Haya (ciudad de Holanda).